Нездоровый микробиом кишечника опасен при пересадке органов

«Нездоровые» паттерны микробиома кишечника связаны с повышенным риском смерти от рака и инфекций после трансплантации сердца, почки, печени или легких. Например, если у человека в кишечнике было большое количество четырех видов Clostridium, то риски смерти от всех причин (особенно от инфекции) после пересадки органов были выше. А бактерии Germigger formicilis, Firmicutes bacterium CAG 83, Eubacterium hallii и Faecalibacterium prausnitzi, наоборот, позволяют снизить риск смерти из-за того, что они вырабатывают противовоспалительное вещество бутират. Работа опубликована в журнале Gut.Нездоровый состав микробиома кишечника связан с повышенным риском смерти от самых разных заболеваний, в том числе от воспалений и диабета. Однако у ученых все еще нет достаточного количества данных о том, какова связь между микробиомом кишечника и долгосрочной выживаемостью при разных состояниях, особенно после пересадки органов.Ученые исследовали связь между дисбактериозом кишечника и смертью от разных причин после пересадки органов у 67 реципиентов сердца, 766 реципиентов почки, 344 — печени и 170 — легких. Специалисты проанализировали 1337 образцов кала пациентов и сравнили их с микробиомом кишечника у 8208 человек, которые живут в том же географическом районе Северных Нидерландов. Средний возраст реципиентов трансплантата был 57 лет, более половины из них — мужчины. Операцию по пересадке органов им проводили в среднем семь с половиной лет назад.За шесть с половиной лет наблюдения умерло 162 человека, которым заменили орган: 88 реципиентов почек, 33 печени, 35 легких и 6 реципиентов сердца. 28% (48 человек) умерли от инфекции, 23% (38 человек) — от сердечно-сосудистых заболеваний и столько же — от рака. Остальные 25% (40 человек) умерли от других причин.Ученые исследовали разные показатели дисбактериоза кишечника в этих образцах: микробное разнообразие, отклонения от нормы, распространенность среди бактерий генов антибиотикорезистентности, факторы вирулентности, помогающие бактериям проникать в клетки и обходить иммунную защиту.Оказалось, что чем больше микробиом кишечника реципиентов отличался от нормы, тем выше была вероятность, что они умрут раньше после трансплантации. При этом не было разницы, какой орган заменяли у пациента. Такую же связь ученые обнаружили для показателей распространенности среди бактерий генов антибиотикорезистентности и факторов вирулентности.Также исследователи нашли 23 вида бактерий, которые влияют на риск смерти от всех причин после пересадки органов. Например, если у человека в кишечнике было большое количество четырех видов Clostridium, HangatellaHathewayi, Veillonellaparvula, то риски смерти от всех причин (особенно от инфекции) после пересадки органов были выше. Высокое количество Ruminococcusgnavus тоже приводило к смерти от всех причин, особенно от рака. Ученые использовали искусственный интеллект, который помог проанализировать все виды бактерий в кишечнике. Нейросеть помогла обнаружить еще 19 различных видов, которые также повышают риск смерти.Зато бактерии Germigger formicilis, Firmicutes bacterium CAG 83, Eubacterium hallii и Faecalibacterium prausnitzi вырабатывают бутират — жирную кислоту, которая является противовоспалительным средством и, наоборот, понижает риски смертности от всех причин. Большое количество этих бактерий позволяет сохранять стенки кишечника в целости и сохранности, благодаря чему снижаются риски развития различных заболеваний, в том числе рака.